首先，复配的农药物理性状不改变。混合后不能出现浮油、絮结、沉淀或变色，也不能出现发热、产生气泡等现象，如果同为粉剂，或同为颗粒剂、熏蒸剂、烟雾剂，一般都可混用；不同剂型之间，如可湿性粉剂、乳油、浓乳剂、胶悬剂、水溶剂等以水为介质的液剂则不宜任意混用。
其次，复配的农药不发生化学变化，以免产生药害。许多药剂不能与碱性或酸性农药混用，比如，在波尔多液、石硫合剂等碱性条件下，氨基甲酸酯、拟除虫菊酯类杀虫剂、福美双、代森环等二硫代氨基甲酸类杀菌剂，易发生水解或复杂的化学变化，从而破坏原有结构。此外，石硫合剂与波尔多液混用可产生有害的硫化铜，也会增加可溶性铜离子含量；敌稗、丁草胺等不能与有机磷、氨基甲酸酯杀虫剂混用。
再次，生物农药不能与杀菌剂混用。在保证正常发挥各自原有作用的前提下，尽可能考虑以下互补效果：复配杀虫、杀菌甚至除草剂，兼治同时发生的多种病虫草害，或混用不同杀菌谱的杀菌剂，扩大防治对象，达到减少施药次数的目的。
无论混用什么药剂，都应该遵循“现用现配，不宜久放”和“先分别稀释再混合”的规定，最好先在小范围进行试验。
